分析3:单细胞样本对齐
前面提到,我们在单细胞多组学中,会得到大量的细胞,每个细胞都有不同的状态。对于mofa而言,2018年的nature使用了scnmt技术,该技术可以同时测定一个细胞的ATAC与RNA情况,但在大部分情况下,我们只能从同一个样本中分别进行ATAC与RNA的测定,而不是对同一个细胞进行测定,但是从理论上来说,应该是有一些细胞是相像的,于是,如何把这些细胞对齐,成为了一个需要解决的问题。
前面提到,我们在单细胞多组学中,会得到大量的细胞,每个细胞都有不同的状态。对于mofa而言,2018年的nature使用了scnmt技术,该技术可以同时测定一个细胞的ATAC与RNA情况,但在大部分情况下,我们只能从同一个样本中分别进行ATAC与RNA的测定,而不是对同一个细胞进行测定,但是从理论上来说,应该是有一些细胞是相像的,于是,如何把这些细胞对齐,成为了一个需要解决的问题。